臨床醫(yī)學院（原臨床醫(yī)學系）是學校最早成立的二級教學機構，主要負責臨床醫(yī)學、麻醉學、康復治療學、兒科學四個專業(yè)的醫(yī)學人才培養(yǎng)。各專業(yè)均進入安徽省一本專業(yè)招生。臨床醫(yī)學專業(yè)為首批國家級一流專業(yè)，麻醉學專業(yè)是安徽省一流專業(yè)。學院擁有17個臨床教研室（含4個實驗中心）、 17所臨床學院、38所實習醫(yī)院。目前已經建立起本科生、碩士研究生、博士研究生的臨床醫(yī)學人才培養(yǎng)體系。

學院一直堅持立德樹人、以人為本，現有專業(yè)管理團隊85人，專任教師1226人，師資中有國家級教學團隊1個、省級教學團隊2個，全國優(yōu)秀教師2人、省級教學名師5人、安徽省“江淮名醫(yī)”28人。2019年以來學院教師承擔國家級、省級質量工程項目107項，學生承擔各層次大創(chuàng)項目213項。近年來獲得安徽省教學成果一等獎2項、二、三等獎多項。

學院秉承原上海第二醫(yī)學院（現上海交通大學醫(yī)學院）嚴謹治學的教育傳統(tǒng)，在傳承的基礎上不斷改革創(chuàng)新，學院推進“臨床學院教學模式”改革，臨床醫(yī)學專業(yè)學生在臨床課程學習階段全部進入臨床學院學習，實現臨床理論課程學習、課間見習和臨床實習無縫對接，促進醫(yī)學生崗位勝任力和實踐能力不斷提高。

學院至今培養(yǎng)了以中國工程院院士劉德培、范先群，中國科學院院士段樹民、陳孝平、王福生等為代表的當代醫(yī)學領軍人物，有以劉新民、盧洪洲、卜軍等為代表的中青年學術醫(yī)療精英，有以“白求恩獎章”獲得者、阜陽市人民醫(yī)院兒科劉曉林醫(yī)生為代表的一大批扎根基層的臨床業(yè)務骨干，為國家和區(qū)域衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展做出重要貢獻。

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培養(yǎng)掌握扎實的基本理論、基本知識和基本技能，具有良好的人文情懷、職業(yè)素養(yǎng)和創(chuàng)新精神，具備一定發(fā)展后勁的初級臨床醫(yī)師。臨床醫(yī)學專業(yè)培養(yǎng)周期內主要課程包括人體解剖學、生理學、生物化學、病理學、藥理學課程，診斷學、內科學、外科學臨床技能學等課程。

學制與學位：五年；醫(yī)學學士學位。

就業(yè)方向：近年就業(yè)率均保持在90%以上，就業(yè)單位主要集中于安徽省內及江浙滬等地區(qū)綜合型醫(yī)院等衛(wèi)生機構、科研院所。

培養(yǎng)具有扎實的臨床醫(yī)學知識與技能、麻醉醫(yī)學知識和臨床技能，具備創(chuàng)新意識和科學研究能力的麻醉醫(yī)學人才。麻醉學專業(yè)培養(yǎng)周期內主要課程人體解剖學、生理學與麻醉生理學、內科學、外科學臨床麻醉學等課程。

學制與學位：五年；醫(yī)學學士學位。

就業(yè)方向：近年來平均就業(yè)率90%以上，就業(yè)單位主要集中于安徽省內及江浙滬等地區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生單位，多為三級醫(yī)院從事麻醉科、急救中心、重癥醫(yī)學科、疼痛診療等領域臨床及科研工作。

培養(yǎng)具有康復治療技術專業(yè)基礎知識和操作技能，從事康復醫(yī)學治療以及相關工作的高級技術應用型、技能型康復治療專業(yè)人才?？祻椭委煂W專業(yè)培養(yǎng)周期內主要課程有人體解剖學、運動生理學、運動生物化學、病理學、康復評定學、臨床醫(yī)學概要等。

學制與學位：四年；理學學士學位。

就業(yè)方向：近年平均就業(yè)率85%以上，就業(yè)單位主要集中于安徽省內及江浙等地區(qū)，就業(yè)方向為康復醫(yī)院、綜合醫(yī)院康復科、養(yǎng)老康復中心、體育運動隊等。

培養(yǎng)適應國家醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展需要，掌握扎實的基礎醫(yī)學和臨床醫(yī)學基本理論、基本知識和兒科基本技能，較強的自主學習和實踐動手能力，具有良好的人文情懷、職業(yè)素養(yǎng)和創(chuàng)新精神的兒科專門醫(yī)學人才。

學制與學位：五年；醫(yī)學學士學位。

就業(yè)方向：本專業(yè)畢業(yè)生主要在各級醫(yī)療機構、醫(yī)學科研單位、醫(yī)學院校和兒童?？漆t(yī)院從事兒科學科研、教學、管理、臨床醫(yī)療等工作。