南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院的前身為1921年創(chuàng)立的東南大學(xué)畜牧獸醫(yī)系，是我國最早成立的畜牧獸醫(yī)系之一。1927年改名為中央大學(xué)畜牧獸醫(yī)系， 1952年全國院系調(diào)整時組建南京農(nóng)學(xué)院畜牧獸醫(yī)系。1984年，更名南京農(nóng)業(yè)大學(xué)，分設(shè)獸醫(yī)系和畜牧系；1994年，經(jīng)農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)，在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)系的基礎(chǔ)上成立動物醫(yī)學(xué)院。

動物醫(yī)學(xué)院學(xué)科實力居國內(nèi)一流，享有較高的國際聲譽。曾為國務(wù)院學(xué)位委員會獸醫(yī)學(xué)科評議組召集人任職單位，現(xiàn)為全國獸醫(yī)專業(yè)學(xué)位教育指導(dǎo)委員會秘書處掛靠單位和副主任委員任職單位。1995年設(shè)獸醫(yī)學(xué)博士后流動站，1998年獲獸醫(yī)學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位和碩士學(xué)位授予權(quán)，1999年獲獸醫(yī)博士專業(yè)學(xué)位和獸醫(yī)碩士專業(yè)學(xué)位學(xué)位授予權(quán)。 擁有農(nóng)業(yè)部動物細(xì)菌學(xué)重點實驗室、農(nóng)業(yè)部動物生理生化重點實驗室、豬鏈球菌OIE參考實驗室、現(xiàn)代化的動物實驗中心等科研平臺。2007年獸醫(yī)學(xué)一級學(xué)科評為國家重點學(xué)科，2010年被評為江蘇省優(yōu)勢學(xué)科。

學(xué)院設(shè)有基礎(chǔ)獸醫(yī)學(xué)、預(yù)防獸醫(yī)學(xué)、臨床獸醫(yī)學(xué)?；A(chǔ)獸醫(yī)學(xué)系設(shè)有動物解剖學(xué)、動物組織胚胎學(xué)、動物生理學(xué)、動物生物化學(xué)、獸醫(yī)藥理學(xué)和獸醫(yī)病理學(xué)等學(xué)科組；預(yù)防獸醫(yī)學(xué)系設(shè)有微生物學(xué)與免疫學(xué)、傳染病學(xué)和寄生蟲學(xué)等學(xué)科組；臨床獸醫(yī)學(xué)系設(shè)有獸醫(yī)內(nèi)科學(xué)、獸醫(yī)外產(chǎn)科學(xué)、中獸醫(yī)學(xué)等學(xué)科組。學(xué)院現(xiàn)有家畜生理研究室、獸醫(yī)寄生蟲病研究室、魚病魚藥研究室、畜禽營養(yǎng)與代謝病研究室、中獸醫(yī)學(xué)研究室、小動物疾病研究室、畜禽疫苗工程中心、獸藥創(chuàng)制中心、獸藥殘留檢測中心、畜禽疾病檢測中心等研究機構(gòu)。學(xué)院現(xiàn)有動物醫(yī)院、動物實驗中心等附屬教學(xué)科研基地。主辦有創(chuàng)刊于1935年的學(xué)術(shù)期刊《畜牧與獸醫(yī)》。

學(xué)院現(xiàn)有教職員工120人，其中正高職稱41人，副高職稱32人（含副教授22人、副研究員1人、高級獸醫(yī)師3人、副編審2人），中級職稱24人。專職教師中90%以上具有博士學(xué)位，其中博士生指導(dǎo)教師35名，碩士生指導(dǎo)教師27名。教師中入選各類國家和部省級人才50余人次；擁有3個農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團隊。

動物醫(yī)學(xué)院承擔(dān)了國家“973”計劃、國家重點研發(fā)專項、國家轉(zhuǎn)基因重大專項、公益性行業(yè)科技專項、國家自然科學(xué)基金等國家及部省級科研項目?！笆濉币詠淼哪甓妊邪l(fā)經(jīng)費超5000萬元，年均SCI收錄刊物發(fā)表150篇左右。豬圓環(huán)病毒滅活疫苗、豬藍(lán)耳病弱毒疫苗分別獲國家二、三類新獸藥證書并成功實施轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)讓經(jīng)費超5000萬元。 “豬鏈球菌病研究及防控技術(shù)”獲2007年度國家科技進步二等獎。

人才培養(yǎng)方面， 90多年來，學(xué)院為國家培養(yǎng)了5000多名本科生和研究生，其中有許多已成為國內(nèi)外著名的科學(xué)家、實業(yè)家和行業(yè)管理者。目前動物醫(yī)學(xué)院有本科生875人；在讀全日制博士生154人（含留學(xué)研究生33人）、全日制碩士生446人（含留學(xué)生3人）；非全日制獸醫(yī)專業(yè)學(xué)位博士生52人、碩士生100人。為了獎勵德、智、體全面發(fā)展的優(yōu)秀本科生、研究生，除國家和校級各項獎學(xué)金外，學(xué)院設(shè)立了“羅清生獎學(xué)金”、 “勃林格殷格翰獎學(xué)金”、“上海海利獎學(xué)金”、“恒豐強獎學(xué)金”、 “浙江諾倍威獎學(xué)金”、“輝瑞普強獎學(xué)金”、 “南農(nóng)高科獎學(xué)金”、“仕必得獎學(xué)金”、“禾豐獎學(xué)金”、“上海農(nóng)場獎學(xué)金”、“臺灣信元獎學(xué)金”、 “武漢回盛獎學(xué)金”等近二十項獎學(xué)金。

學(xué)院國際學(xué)術(shù)交流與國際化辦學(xué)日趨活躍，近5年來，我院教師先后有近100人次到國外進修、攻讀博士學(xué)位、考察、合作科研。與美國、日本、加拿大、丹麥、澳大利亞、英國、西班牙等國的有關(guān)學(xué)校、研究機構(gòu)建立了合作關(guān)系，與德國漢諾威獸醫(yī)學(xué)院建立了校際關(guān)系。從2013年開始與加州大學(xué)戴維斯分校獸醫(yī)學(xué)院在中國南京聯(lián)合開辦了國際高端獸醫(yī)繼續(xù)教育課程。此外，學(xué)院每年吸納大量留學(xué)生前來學(xué)習(xí)深造，先后舉辦了近20期國際獸醫(yī)針灸與中藥培訓(xùn)班。

展望未來，動物醫(yī)學(xué)院全體師生員工將以飽滿的熱情，求是創(chuàng)新，朝著世界一流研究型學(xué)院目標(biāo)邁進！