國家級重點學科（3個）：中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中醫(yī)內(nèi)科學。

省級重點學科（14個）：中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中西醫(yī)結合基礎、中藥學、針灸推拿學、中醫(yī)兒科學、方劑學、中醫(yī)婦科學、中醫(yī)內(nèi)科學、中醫(yī)外科學、生藥學、眼科學、中醫(yī)骨傷科學、中醫(yī)全科醫(yī)學。

國家中醫(yī)藥管理局重點學科（29個）：中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)文獻學、中藥藥劑學、中西醫(yī)結合基礎、中西醫(yī)結合臨床、中醫(yī)心病學、中醫(yī)腦病學、中醫(yī)腫瘤病學、中醫(yī)婦科學、中醫(yī)兒科學、中醫(yī)全科醫(yī)學、針灸學等。

博士后流動站（3個）：中醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)結合醫(yī)學；

國家級特色專業(yè)（4個）：中醫(yī)學（國家二類特色專業(yè)，教育部“地方高校第一批本科專業(yè)綜合改革試點”專業(yè)）、中藥學、制藥工程、針灸推拿學。

省級特色專業(yè)（11個）：中醫(yī)學、中藥學、制藥工程、針灸推拿學、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、康復治療學、中草藥栽培與鑒定、護理學、應用心理學、信息管理與信息系統(tǒng)、眼視光學等專業(yè)。

博士學位授權學科（3個）：中醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)結合醫(yī)學。

山東省一流學科（2個）：中醫(yī)學、中藥學。