“食品工程”專業(yè)成立于1984年，1985年招收第一屆本科生，1986年經(jīng)云南省政府批準(zhǔn)為省屬重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，2001年被授牌“云南省重點(diǎn)學(xué)科”；2005年獲得“食品科學(xué)”二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)，2008年，招收食品科學(xué)與工程和食品質(zhì)量與安全兩個(gè)方向的本科生。2010年獲得“輕工技術(shù)與工程”專業(yè)碩士學(xué)位點(diǎn)。2013年與云南省人民政府食品安全委員會(huì)共建“云南省食品安全研究院”。2014年“食品質(zhì)量與安全”本科專業(yè)獲得批準(zhǔn)并招生。2017年獲得“食品科學(xué)與工程一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)”。2018年云南省食品安全研究院與現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程學(xué)院組建“農(nóng)業(yè)與食品學(xué)院”。2019年，“食品科學(xué)與工程”專業(yè)入選云南省一流專業(yè)。2020年“食品科學(xué)與工程”專業(yè)入選國(guó)家一流專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，并通過(guò)工程教育專業(yè)認(rèn)證，同年，在“生物與醫(yī)藥”工程領(lǐng)域招收專業(yè)學(xué)位碩士。2021年食品科學(xué)與工程學(xué)院正式成立。

學(xué)院現(xiàn)有教職工42人，其中專任教師37人，博士生導(dǎo)師5人，碩士生導(dǎo)師28人；教授10人，副教授14人，博士30人，云南省中青年學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人2人，云南省青年人才12人，云南省優(yōu)秀研究生指導(dǎo)教師1人，中國(guó)科協(xié)青年托舉工程人才1人。建立了一支學(xué)歷層次、高教學(xué)科研強(qiáng)，滿足多層次人才培養(yǎng)需要的師資隊(duì)伍。

學(xué)院擁有云南省特色果蔬健康產(chǎn)品工程研究中心、云南高原特色果蔬加工公共科技服務(wù)平臺(tái)、云南省高校高原特色果蔬加工工程研究中心、昆明市食品高值化加工及安全評(píng)價(jià)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、云南省高校食品資源生物功能因子研究開(kāi)發(fā)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、食品安全分析與檢測(cè)技術(shù)學(xué)科方向團(tuán)隊(duì)、食品精深加工與副產(chǎn)品高值化利用學(xué)科方向團(tuán)隊(duì)，儀器設(shè)備總價(jià)值3000余萬(wàn)元，滿足科研教學(xué)的需要。

近五年，學(xué)院獲云南省自然科學(xué)獎(jiǎng)和科技進(jìn)步獎(jiǎng)等省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)5項(xiàng)，在高水平期刊上發(fā)表SCI論文200余篇，共承擔(dān)科研項(xiàng)目60余項(xiàng)，其中國(guó)家自然科學(xué)基金16項(xiàng)，總經(jīng)費(fèi)超6000萬(wàn)元，有效發(fā)明專利50余項(xiàng)，并實(shí)現(xiàn)了科研成果轉(zhuǎn)讓。獲得云南省教學(xué)成果獎(jiǎng)1項(xiàng)，云南省研究生優(yōu)秀科技創(chuàng)新成果獎(jiǎng)2項(xiàng)，云南省研究生優(yōu)秀實(shí)踐成果獎(jiǎng)1項(xiàng)；云南省一流課程2門(mén)，云南省研究生優(yōu)質(zhì)課程1項(xiàng)，云南省專業(yè)學(xué)位研究生教學(xué)案例庫(kù)建設(shè)項(xiàng)目1項(xiàng)。