中藥學(xué)院創(chuàng)辦于2003年5月，其前身是中藥系，2005年更名為中藥學(xué)院。

現(xiàn)有中藥學(xué)、中藥制藥、中藥資源與開發(fā)、中草藥栽培與鑒定四個本科專業(yè), 有中藥學(xué)（學(xué)術(shù)型）一級學(xué)科碩士學(xué)位點和中藥學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位點，二級學(xué)科碩士授權(quán)點1個（生藥學(xué)）。中藥學(xué)專業(yè)為廣東省特色建設(shè)專業(yè)，中藥學(xué)和中藥資源與開發(fā)專業(yè)是學(xué)校重點建設(shè)專業(yè)，“中藥分析學(xué)”學(xué)科為國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科，“中藥學(xué)”課程為國家級精品課程。有“廣東高校中藥質(zhì)量工程技術(shù)研究中心-中藥炮制工程技術(shù)中心”,國家中醫(yī)藥管理局重點研究室“中藥數(shù)字化質(zhì)量評價技術(shù)研究室”"。

學(xué)院下設(shè)的中藥標(biāo)本館與藥用植物園均為“國家大學(xué)生文化素質(zhì)教育基地”、“廣東省青少年科學(xué)教育基地”和“廣州市青少年科學(xué)教育基地”。與香港大學(xué)中醫(yī)藥學(xué)學(xué)部共建有“現(xiàn)代中藥研究中心”，并建有數(shù)碼互動實驗室及分析測試中心等。學(xué)院已建立了近100余個教學(xué)實踐基地，15個研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地，8家產(chǎn)學(xué)研基地，為學(xué)生提供了良好的教學(xué)、實踐條件。

中藥學(xué)院致力以培養(yǎng)中藥創(chuàng)新人才為方向，以促進學(xué)生成長成才為目標(biāo)，創(chuàng)新育人理念和人才培養(yǎng)模式，推進學(xué)生創(chuàng)新能力和實踐能力的培養(yǎng)。近年來學(xué)院和醫(yī)藥企業(yè)合作辦學(xué)，開辦了康美創(chuàng)新班（與廣東康美藥業(yè)股份有限公司合作）和匯群創(chuàng)新班（與廣東匯群藥業(yè)有限公司合作），加大實踐教學(xué)，促進創(chuàng)新性、應(yīng)用型中藥學(xué)專業(yè)人才的培養(yǎng)。近年來中藥學(xué)院學(xué)生在省級國家級的科技類創(chuàng)業(yè)類比賽中取得優(yōu)異成績，在 “挑戰(zhàn)杯”科技競賽和數(shù)學(xué)建模競賽中共獲得全國一等獎2項、三等獎2項；廣東省一等獎6項、二等獎6項和三等獎10項的成績。畢業(yè)生就業(yè)率連續(xù)多年保持在98%以上。