本專業(yè)設(shè)立于2003年，2004年開始招生。2008年先后通過上海市教育評估院和教育部高等學校制藥工程專業(yè)教學指導委員會新專業(yè)建設(shè)檢查和評估。2017年通過國家工程教育專業(yè)認證，2020年通過國家工程教育專業(yè)認證復審，2019年獲批上海市一流本科專業(yè)建設(shè)點，2020年獲批國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點。專業(yè)堅持學?，F(xiàn)代化工程應用型特色大學辦學定位，培養(yǎng)具有社會主義核心價值觀，符合經(jīng)濟和制藥領(lǐng)域發(fā)展需求，具備良好的人文社會科學素養(yǎng)，具有社會責任感和職業(yè)道德，能夠在實踐中發(fā)揚崇尚勞動、無私奉獻的精神，具有創(chuàng)新意識、終身學習、團隊合作與溝通以及跨文化背景等可持續(xù)發(fā)展?jié)撃芗八刭|(zhì)，具有扎實的數(shù)學和自然科學基礎(chǔ)、系統(tǒng)的制藥工程專業(yè)知識、工程實踐能力、專業(yè)表達能力，能夠在制藥工程及其相關(guān)領(lǐng)域從事生產(chǎn)管理、技術(shù)研發(fā)、工程設(shè)計等工作的應用型工程技術(shù)人才。

化學與藥學系列課程：無機化學、分析化學、有機化學、物理化學、生物化學、化工原理、藥物合成反應、藥物化學、藥理學、藥物分析、天然藥物化學、藥劑學等。

工程技術(shù)系列課程：制圖基礎(chǔ)、制藥工藝學、制藥設(shè)備與車間設(shè)計、制藥分離工程、藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理工程、制藥過程安全與環(huán)保、醫(yī)藥技術(shù)經(jīng)濟與項目管理等。

計算機系列課程：計算機應用基礎(chǔ)、VB程序設(shè)計等

本專業(yè)畢業(yè)生可在制藥工程（或醫(yī)藥生物技術(shù)）領(lǐng)域相關(guān)的生產(chǎn)企業(yè)、營銷企業(yè)、科研院所、藥品監(jiān)督管理部門等企、事業(yè)單位從事藥品生產(chǎn)、管理、營銷、檢驗監(jiān)督和研發(fā)等工作，也可報考藥學、生物技術(shù)、化學工程與技術(shù)、中藥學等相關(guān)學科領(lǐng)域的研究生。